Di movie ini menceritakan petualangan Conan yang berusaha
menghentikan pembajakan pesawat terbang yang kebetulan ia naiki. Berawal
dari kabar tentang Kid yang hendak mencuri batu nilam yang berharga,
conan berusaha mencegahnya, yang pada akhirnya Conan malah bersatu
dengan Kaito kid untuk menghentikan pembajakn di atas pesawat tersebut.